Los mayores obstáculos para la puesta en marcha y el mantenimiento de la iniciativa de Datos Abiertos son:

• Falta de comprensión por en algunas áreas legales del gobierno sobre la importancia de la iniciativa de Datos Abiertos; y sobre las licencias abiertas que requieren los datos para ser catalogados como “Datos Abiertos”.

• Establecer mecanismos de coordinación internos que garanticen una eficaz implementación de una política de Datos Abiertos, que ayuden a promover el uso de los datos y ofrezcan soluciones adecuadas para poder hacer frente a la demanda.

• La falta de capacidad de las entidades federales para acceder a algunos de los tipos de datos más importantes, (ej. datos catastrales, el gasto sanitario por ubicación, los gastos menores al 30% de Seguro Popular), debido a la autonomía de los gobiernos estatales y locales bajo la estructura de política descentralizada de México.

• Algunos altos cargos de Secretarías y entidades clave han expresado su interés en generar Datos Abiertos, sin embargo todavía no son visibles de cara al público porque sus acciones no han transcendido ni fuera ni dentro del gobierno.